すすぎ水は入力だけでよいのでしょうか、出力にも同じ量を書くのでしょうか

入力は製品フロー（水道水）、出力は廃棄物フローとしての廃水にして、その廃水を処理場へ送ってください。量は入力も出力も同じで構いません。

避けたいのは、同じ1つのフローを入力と出力に置いて相殺する書き方のほうです。量が釣り合っていることが問題なのではなく、水が「入って、使われて、廃水として出た」という経過が消えてしまうのが問題です。

符号を使うやり方（double negative）でも計算は成立します。ただし読み返したときに意味が取りにくく、符号の付け忘れが起きやすい書き方です。